Four kinds of histones are combined together as you can see in the picture abov…
Cis-regulatry element: Cis- regulatory element/ module은 단백질을 생성하는 유전자, 혹은 long…
최근에 아는 동생으로 부터 여러가지 질문을 받아서 답변을 해주었는데 이를 포스팅해서 공유해 보고자 한다. 또 다른 분들께 다른 질문들을 받으면…
이전 포스팅을 요약해서 설명하자면 범주형자료에서 독립성 검정(두 변수가 독립인지아닌지)에 대한 지표로 오즈비(odds ratio)를 이용할 수…
초기하분포는 무엇인가? 전체 N개 중에서 "성공" 과 "실패" 가 각각 K 개와 N-K개가 있다고 하자.…
![[R 코드] HeatMap그리기 RNA-seq Heatmap 해석](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEg2WCSrhpdDBe2m32D2pGOpuaPtPnmIz2LM802wdfPWMmfCwc9KL8vpfRDitnthvCdJZKX6guzr2Q1PyWJ-T5CiNTfz-_SKKm5EsUkczoH1dKWI5x-Cp6jTl84cU2Ze8fcSqqAZ7hjUgtrn/w72-h72-p-k-no-nu/Picture1.png)
RNA seq 분석을 하다보면 Heatmap을 그려야 할 상황이 올때가 있다. 아래의 예시 그림은 6개 샘플에 대한 유전자 heatmap이다…
1. 범주형자료란? 오즈비는 범주형 자료에서 쓰이기 때문에 범주형 자료에 대한 이해가 필요합니다. 범주란 분류하려는 카테고리입니다 . 해당 …
![[머신러닝] 머신러닝, 딥러닝 Feature/Attribute , Class 뜻. (feat. Feature selection 이 필요한 이유)](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgqVIPx3e9cNEeJrk2qEK5UJqDI_DLv1KAkXOt8eTZneb2xxpeGXVqEcDgcBpRaywR4V39ey5gfh94wZZPMUNdvKdIdqmvLeHCSDa7Va-Tn2v8OIpSGufjkyFztOfvBE0SIk9PzKN4dCY6f/w72-h72-p-k-no-nu/Capture.PNG)
이번에는 저번 포스팅에 이어서 머신러닝에서 중요한 용어인 feature에 대해서 생각해 볼것이다. feature는 한국어로 특징이라고도 해석이…
![[머신러닝] Clustering 과 Classification 뜻.](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEg5v_ib5ls08P98tJiNFuURPNYRtWGMi2LSAkSfWa5ZLZkZa37apOYS-Em45briAWNXy-w73oIsyswLCX1rY-tzO6LWlu0L61Ytx26SXfSDThynMnInRLb0LO2opTtVCJmEJYscgS9FDkbv/w72-h72-p-k-no-nu/ML3.png)
20년전 우리가 화면을 터치해서 인터넷을 할 수 있는 핸드폰을 사용할 것이라고 상상한 사람이 있었는가? 기술의 발전 속도는 우리가 상상하는 것…
Natural selection 으로 인한 진화는 4 가지의 논제는 ? 1. Population 안에 individuals 는 다…
첫번째 이론은 Rate-of-living theory이다. 이 이론은 세포와 조직에 replication, transcription, tra…
Sexual reproduction ( 유성생식 ) - Sexual reproduction 은 암수 개체가 생식 세포를 만들…
![[메타지놈 분석 3탄] Metagenomics Dada2 를 통한 대표 시퀀스 찾기 및 Diversity 분석](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiPUKRfmqKz1RfIOnIWjykayeIrcnPAq2dKJQnQFFBsZtH_LirLRLcQ4q0ha3x_htbmlPoGQTQ-Np6spnARolY4nxEFySVfv3ihGyHHRX2ovaS4o_Nxqdq6K-af3JM2KpnN9bV2fwjljA0S/w72-h72-p-k-no-nu/22323.PNG)
저번 포스팅에서는 paired end 시퀀스를 Merge 병합하는 데까지 알아보았다. 다음 단계에서는 merge된 read들은 중복을 제외하…
![Metagenomics 메타지놈 분석 결과 해석 - 시퀀스 Merge 병합 하기, 시퀀싱 결과 해석 [메타지놈 분석 2탄]](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEie2klpvLg7Gz5EisnPn7WomHDtXSs4bXT9R-tfN6MsUT3hfz56eTc3kFx3wxikvi0mxrq3PcMScQnlvqAG7H6dvovemgHanpgSTCw-7pgD8hX4BTjLbURYJQGbBK8Kx6QFiBc5uGz0Dhyg/w72-h72-p-k-no-nu/ss.PNG)
이번 포스팅에서는 저번에 언급한 파이프 라인을 따라 메타지놈 분석을 수행했을 때 나오는 정보들과, 이를 어떻게 해석할 것인지에 대해 다뤄보겠다…
![Metagenomics 메타지놈 분석 개요, 절차 [메타지놈 분석 1탄]](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhWc6iRxs48I-_uDZsKZ4LYwmO6WVn0vXbw1so_8RAJC_EEMQ9OLoVqKR8BMSE22NIn02Bj02jONo0iS4oA0UHIBNlVlzEUGVsT6johtfPM6IzQFQlkuQ3nCA7MIJn7sKU0pLW48Vre8QJ8/w72-h72-p-k-no-nu/12.png)
장내 미생물이 큰 관심으로 떠오르면서, 어떻게 메타지놈 데이터를 분석하는 지에 대해 관심이 높아지고 있다. 여기에서는 메타지놈 분석을 위해 생…
저번 포스팅에서는 히스톤 마커가 무엇인지에 대한 기본 개념에 대해서 다뤄보았다. 이번에는 여러 히스톤 마커를 소개하고 각각의 의미를…
Epigenomics를 공부하다보면 꼭 등장하는 기본개념인 Histone modification marker 에 대해서 알아보고자 한다. 혹…
이전 포스팅 에서는 positive selection과 negative selection의 개념에 대해서 알아보았다. 이번 포스팅에서는 pos…
