싱글셀이아닌 Bulk RNA-seq에서는 유전자 발현양을 분석할때 샘플 (또는 Replicate) 의 유전자 발현양을 간단하게 box pl…
1: Reference 구축 *해당 문서는 CellRanger-ATAC/1.2.0 기준으로 작성되었습니다. (최신 업데이트 버전 :2.0) …
이때, cell5의 경우1이 빈번한데, 이게 diploid effect 일 수도 있다. 그래서 이러한 영향을 줄이고 셀들간의 Normaliz…
Tn5 insertion 이 유전자로부터 얼마나 떨어져있는지 계산해서 각 Tn5 별로 가깝게 위치한 유전자를 찾는것을 Gene body acc…
QC의 마지막 단계에서 Peak을 필터링한다. 이때 Peak accessibility frequency 그래프를 그리지만 큰 의미는 없다. …