N50 은 contig N50을 의미한다. 
Contig N50이란?

 제일 긴 contig  부터 짧은 순으로 줄을 세워서  제일 긴 Contig부터 그 길이를 더해 갔을 때 유전체의 50%를 커버하는 순간의 Contig  길이가 N50이다. 

N50의 수치가 길수록 assembly가 성공적으로 잘 되었다는 뜻이다.