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Bioinformatics(생물정보학)
CAGE(Cap analysis gene expression) 뜻
CAGE(Cap analysis gene expression) 뜻
Cap analysis gene expression(CAGE)는 mRNA의 5'의 끝의 유전자 발현량을 측정하는 기술이다.
샘플링 단계에서 mRNA의 시작부분인 5' cap 만을 이용하여 그 부분의 발현을 조사한다.
때문에 전체 mRNA의 발현량은 알기 힘들지만, Transcription start site와 promoter를 알 수 있다는 점에서 사용 된다.
전체 mRNA 발현량은 RNA-seq으로 분석할 수 있으며 때문에 RNA-seq과 CAGE가 함께 사용되기도 한다.
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