Autonomous란 "자발적인"이란 뜻입니다.
그렇다면 cell autonomous는 무엇을 뜻할 까요?
Cell autonomous 는 돌연변이화 된 세포에서만 돌연변이 형질을 보이는 유전적 특징을 말합니다.
반면 Non-cell autonomous (혹은 nonautonomous)는 돌연변이화 된 세포가 다른 세포들에게 돌연변이 형질을 야기시키는 유전적 특징을 말합니다.
그러면 이것을 Single cell 기술과 protein 의 일종인 Transcription factor와 관련해서 생각해 볼수 있습니다.
*Non-cell autonomous transcription factor: 세포 내에서만 영향을 미치는 transcription factor
*Cell autonomous transcription factor: 다른 세포에도 영향을 미치는 transcription factor
Single cell 기술은 RNA-seq 이나 ATAC-seq 등을 세포레벨에서 수행하는 것입니다.
싱글셀 시퀀싱을 하게 되면 각각 세포내에서 유전자 발현량, 어떤 크로마틴이 열리는지 확인 할 수 있습니다.
Single cell ATAC-seq을 수행하게 되면 세포 별로 어떤 크로마틴이 열렸는지 확인 할 수 있고
세포별로 어떤 Transcription factor가 붙는지 알 수 있습니다.
이때, 세포내에 유전자가 열려있는 지역과 그 주변을 확인하면
Non-cell autonomous Transcription factor인지 autonomous Transcription factor인지 알 수 있습니다.
예를들어 Cell A 에서 gene1부분은 닫혀있는데 Transcription factor1이 위치한 부분은 열려있다고 합시다.
이때 Cell B를 확인했더니 gene 1이 열려있고 Transcription factor1이 닫혀잇다면
Transcription factor1 이 다른 세포(Cell B)에서 작용을 한다는 증거가 될 수 있습니다.
이 때 Transcription factor1은 Cell autonomous transcription factor가 됩니다.
