[유전체학] Promoter, enhancer 정의/ plant 에서의 특징

Promoter란 transcription start site 주변에 50-100bp 주변의 transcription을 직접적으로 시작시키는 DNA서열을 의미합니다.

식물에서 Promoter란 과거에는 transcription start site로 부터 1-2천 베이스페어 앞에 있는 지역을 가르쳤는데요.

이 정의는 enhancer를 포함할 수도 있고 애매해서 위의 정의가 더 정확하다고 할 수 있을 것입니다.

Promoter는 TATA box를 가지고 있는 경우가 많습니다.

TATA box 는 TATA-box binding protein(TBP)라는 transcription factor에 의해 인지됩니다. 그러나 식물에서는 대다수의 promoter는 TATA box를 가지고 있지 않습니다.

Enhancer

Enhancer 란 cofactors와 함께 Transcription factor가 붙어서 전사의 시작을 증폭시키는 DNA 서열 을 의미합니다.

Enhancer의 위치는 promoter와 상당히 떨어져 있으며 다양한 거리의 범위를 가지고 있습니다. 종마다 다르나, 1M bp 1,000,000bp 떨어져 있는 enhancer도 있습니다.

식물에서는 b1(bosster1)이라는 유전자의 enhancer를 예로 들수 있습니다. 이 유전자의 전사를 증폭시키는 enhancer 는 해당 유전자인 b1 으로 부터 ~100 kb 까지 떨어져 있다고 알려져 있습니다.

또한 옥수수에서 높은 유전자 발현량을 보이는 bx1 유전자의 경우 해당 유전자에 140kb 떨어진 거리에서 enhancer가 발견되었습니다.